Perusteellinen huolto sisältää kaikki tarvittavat kohdistukset, säädöt ja huollot koneiston, koskettimiston, pedaalikoneiston ja sammuttajakoneiston osalta. Myös vasaroiden hionta ja intonoinnin tarkka säätö sisältyvät huoltoon, jolloin flyygeli saavuttaa optimaalisen äänenlaadun ja kosketuksen. Säännöllisesti huolletut flyygelit pysyvät hyvässä kunnossa pidempään ja vaativat vähemmän työtä, kun taas pitkään huoltamattomat vaativat perusteellisempia toimenpiteitä.